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SSR实验服务常见问题解答

1）公司可以做哪几种荧光标记的检测？

    我们采用ABI3730X Genetic Analyzer  对扩增片段进行毛细管电泳检测，采用ROX500

作为分子量分析内标（红色），PCR引物可以标记蓝色（FAM）、绿色（HEX）、

黄色（NED），客户只需提供引物序列，我们负责荧光引物的合成，同时根据扩增

片段的长度，设计引物组合、标记颜色组合，对多个位点复合扩增，同时检测，以

便低成本高效的给客户完成实验。

2）SSR相关收费标准？

    按照实验完整度，分以下几种：

a.客户提供提供相关实验位点信息，我们完成整个实验，其中包括引物筛选及后续全

部试验，收费为：20元/反应（不包括引物合成费），荧光引物的合成300元/对（包

括上下游引物，荧光引物只标记其中一条）。b .客户按照标记要求，送来的荧光引

物扩增后的PCR产物,收费为900元/板（96个样，包括内标价格）。c .对于多个位点同

时检测，如：4个位点，混合上样，我们考虑到数据分析工作，每增加一个位点多100

元，即：4个位点，在原有基础上增加了3个位点，共1200元。

3）是否可以提供全部检测的峰图？

    我们可以提供部分检测峰图，如：每个位点检测到的等位基因对应的峰图，因为

同一等位基因峰图基本一致，所以不一一提供。

4）除了原始数据，一些常见遗传多样性分析参数是否可以提供？

    我们可以提供各位点检测到的等位基因，等位基因频率、多态信息含量（PIC）、期

望杂合度、观察杂合度等常见的一些遗传学参数。

5）对于一些未发表STR位点的物种，是否可以进行引物开发？

    对于未发表STR位点的物种，我们一般通过两种方法进行STR引物的开发。第一，

从已发表的的近缘物种的SSR位点中筛选，多态性高，特异性好的SSR位点。但一般

特异性不好。第二，我们通过磁珠富集法筛选开发SSR引物，该方法筛选的引物物种

特异性较好，但实验周期会长一些。

6）是否可以做SSR片段的回收克隆、测序？

     我们可以做STR的回收克隆测序，具体价格可协商。